Markus on osalenud aktiivselt Kanada eestlaste kogukonnas. Tema alustas Musta Lindi Päeva aktsiooni, kus Ida- ja Kesk-Euroopa rahvad nii siin- kui sealpool raudset eesriiet ühinesid 23. augustil (esmakordselt 1986) Molotovi-Ribbentropi pakti meenutuseks ja protestiks selle tagajärgede vastu. Markus Hess valiti ka Musta Lindi Päeva Rahvusvahelise Komitee esimeheks, samuti on ta olnud Committee for a Peaceful Transition to Freedom esimees. Ta on olnud ka Eestlaste Kesknõukogu Kanadas (EKN) ning Kesk- ja Ida-Euroopa Nõukogu (CEEC) esimees, osales heategevusorganisatsiooni Tribute to Liberty juhatuse töös ning oli valitud Eesti Kongressi delegaadiks. Markus juhtis 1991. a kampaaniat, mille tulemuseks kaared Toronto raekoja ees said nimetatud Vabaduskaarteks (Freedom Arches).
Markus Hess on kuulunud ka Eesti Maja Torontos ning ajalehe Meie Elu juhatusse ning oli Toronto Eesti Meeskoori liige. Akadeemiliselt kuulus Korp!Vironia ridadesse.
Markus Hess on Poola Kuldristi, Valgetähe V klassi teenetemärgi ja Eestlaste Kesknõukogu Kanadas Kuldteenetemärgi kavaler.
Vene Föderatsioon kandis märtsis 2022 Markus Hessi ühena 313 kanadalasest ebasoovitavate isikute nimekirja, kellele keelati sisenemine Venemaale.
